取締加整治 治理工業污染
工業污染源是對水體產生污染的最主要污染源。工業生產的各個環節都可能產生廢水，影響較大的工業廢水則主要來自冶金、電鍍、造紙、印染、制革等企業。針對工業污染防治，《方案》給出取締“十小”企業、 專項整治十大重點行業、集中治理工業集聚區水污染三條整治措施。
2016年，建立“十小”企業取締清單，全部取締不符合產業政策的小型造紙、制革、印染、染料、煉焦、煉硫、煉砷、煉油、電鍍、農藥等嚴重污染水環境的生產項目。
專項整治十大重點行業方面，開展造紙、焦化、氮肥、有色金屬、印染、農副食品加工、原料藥制造、制革、農藥、電鍍十大重點行業企業情況排查，2016年確保完成改造總任務的10%。
集中治理工業集聚區水污染方面，加強工業集聚區污檢查工作，加強對現場端監控設施運行的檢查督查，定期在門戶網站向社會公開污染源監管信息。
強化與保護 監管從水源到水龍頭
水源安全離不開嚴格有效的監管措施。為保障飲用水水源安全，南寧將加強從水源到水龍頭全過程監管。如自2016年起每季度第一個月20日前向社會公開上一季度飲用水水源、供水廠出水和用戶水龍頭水質狀況。
此外，還要開展集中式飲用水水源環境保護專項執法檢查，依法查處影響飲用水水源水質的違法行為;公布飲用水水源保護區、飲用水備用水源保護區的具體范圍、地理界線;在飲用水水源保護區、飲用水備用水源保護區設置標志牌或者標志樁，對飲用水水源一級保護區實行封閉式管理等。
《方案》還要求，全力推進邕江5個集中式飲用水水源地取水口上移各項工作，2016年底前基本完成劃定1000人以上農村集中供水工程飲用水源保護區。
治理加修復 消除城市黑臭水體
南寧市共有18條內河，目前，不少內河都處于河水渾濁、水體發黑發臭的現狀。《方案》談到，南寧將積極采用政府和社會資本合作模式(PPP模式)開展內河全流域治理工作，其中2016年繼續推動那考河PPP整治項目，啟動水塘江、馬巢河、沙江河、心圩江等內河PPP整治項目。
采取控源截污、垃圾清理、清淤疏浚、生態修復等措施，加大黑臭水體治理力度，每半年向社會公布治理情況。2016年制定南寧市建成區黑臭水體整治方案，建成區36處黑臭水體(共96.8千米)整治工作將全部開工。2016年，建成區黑臭水體消除比例達20%以上，爭取達到40%，預計2017年底完成，基本消除南寧建成區內河、湖泊、坑塘等黑臭水體。
另外，《方案》還提出將防治畜禽養殖污染，進一步推進畜禽養殖禁養限養工作，依法關閉或搬遷禁養區內的畜禽養殖場(小區)和養殖專業戶，限養區內畜禽養殖場、養殖小區實現污染物達標排放，限養區內不得新建、擴建畜禽養殖場、養殖小區。
“康復”目標
飲用水水源：2016年，城市5個集中式飲用水水源水質達到或優于Ⅲ類比例為100%，縣級集中式飲用水水源水質達到或優于Ⅲ類比例總體達到90%以上。
江河湖庫：2016年，左江、右江、武鳴河、邕江、郁江5條主要河流國家考核監測斷面以及大王灘水庫、西津水庫水質優良(達到或優于Ⅲ類)比例總體達到100%。
城市水體：2016年，南寧市城市建成區黑臭水體消除比例達20%以上，爭取達到40%。
地下水：地下水2個質量考核點位水質級別保持穩定。
突發環境事件：2016 年，確保不發生較大以上水污染突發環境事件。
