治湖先治河，治河先治污。于2013年12月開工建設的環巢湖鄉鎮污水處理廠，建成后可實現合肥境內環湖及其干流周邊鄉鎮鎮區污水處理的全收集、全覆蓋、全處理，其“設計-建造-運營”一體化的模式，較好解決鄉鎮污水收集難和運營管理維護難的問題。

管住污染源頭，才能確保入湖河流水質。合肥市采取分段歸屬、責任到人的“河長制”，從源頭上確保入湖河流的水質。目前已納入“河長制”管理的河道共103條，2014年度通報“河長制”問題288個，完成整改218個，共整治排污口65個，清理河道兩側垃圾點772個、河道違規開墾面積35萬平方米，河道(溝渠)清淤366公里，取締畜禽養殖點672個，17條河流的29個斷面污染物濃度呈下降趨勢。

2013年、2014年巢湖湖區藍藻水華面積、頻次及藻密度都明顯低于上年同期水平。

通過河湖生態補水、濕地建設、面源污染治理等綜合治理，如今合肥環巢湖旅游大道上游人如織，環湖濕地等景觀吸引游人紛至沓來，巢湖的生態效益、休閑功能、審美功能得到了展示。首屆合肥國際馬拉松賽也在濱湖沿線舉行，來自17個國家和地區的超萬名參賽選手飽覽了巢湖風光。