該《方案》提出，深化水利改革的目標任務是著力推進水權、水價、水利管理和水利投融資等重要領域和關鍵環節的改革，以水權制度奠基礎，以水價改革增動力，以投融資添活力，以水管改革促激力，力爭在制約水利發展的根本性、長期性問題上取得突破，同步協調推進其他各領域改革，使水利發展更加充滿活力、富有效率，讓水利改革發展成果更多更公平惠及群眾。主要內容涵蓋加快水行政管理職能轉變、推進水資源管理體制改革、建立健全水權制度和水價機制、加強水生態文明制度建設、建立嚴格的河湖管理制度、完善水利投入穩定增長機制、深化水利工程建設和管理體制改革、創新農村水利組織發動機制、健全基層水利管理體制機制、強化水利法治建設、推進水利科技創新等。