學會設有理事會、監事會。理事會為學會領導機構，成立了中共浙江省環境科學學會理事會功能型支部，學會理事長許履中任支部書記。學會現有個人會員2000余名、單位會員178個，專家庫成員1300余人。
學會設立了環境化學、廢水處理與資源化、大氣污染控制、工業廢氣污染控制、固體廢物處置、土壤與地下水環境、環境監測、環境咨詢、農村環境、城市生態環境、大氣PM2.5與臭氧協同控制、微塑料與納米顆粒物、生態環境政策與規劃、廢棄物質循環利用與污染防治、綠色設施、環境經濟、流域生態修復、生活垃圾分類處理與污染防治等18個專業委員會。學會秘書處是理事會領導下的日常工作機構，成立了中共浙江省環境科學學會秘書處支部，秘書處下設辦公室、學術交流部、科技咨詢與推廣部、科普部、會員部五個部門。
近年來，在省生態環境廳和省科協指導下，學會堅持為科學技術工作者服務、為創新驅動發展服務、為提高全民科學素質服務、為黨和政府科學決策服務，在服務全省及長三角區域環境保護事業、企業環保咨詢、高端學術交流、環保科普宣傳、承接政府職能轉移及環保科技成果評價等方面工作卓有成效，受到政府、企業和社會的普遍好評。學會連續十年以上被省科協評為“全省科協工作先進單位”；2017年被人力資源社會保障部、中國科協授予“全國科協系統先進集體”榮譽稱號，是浙江省唯一獲此殊榮的省級學會；2019年大學生環保科普行活動獲得國家科技部“科技周”表彰；2020年入選省科協學會能力提升工程第一批一流學會試點名單，入選省民政廳2020年浙江省品牌社會組織；2021年獲得中國科協“全民科學素質工作先進集體”、中國環境科學學會“大學生在行動優秀組織單位”、浙江省民政廳“5A級社會組織”（復評）等榮譽，學會代表作為浙江省代表成員參加兩院院士大會和中國科協第十次全國代表大會；2022年獲得“2022年度長三角優秀科技志愿服務組織”榮譽稱號；2023年獲得“2023年度浙江省品牌社會組織”榮譽稱號。
學會特色活動
定期開展學術交流
積極承接政府職能
服務地方協同創新
注重環保科普工作
制定完備的工作制度。（公開，可下載）
