聚丙烯酰胺本身及其水解體沒有毒性，聚丙烯酰胺的毒性來自其殘留單體丙烯酰胺(AM)。丙烯酰胺為神經性聚丙烯酰胺聚丙烯酰胺致毒劑，對神經系統有損傷作用，中毒后表性出肌體無力，運動失調等癥狀。因此各國衛生部門均有規定聚丙烯酰胺工業產品中殘留的丙烯酰胺含量，一般為0.5%---0.05%。聚丙烯酰胺用于工業和城市污水的凈化處理方面時，一般允許丙烯酰胺含量0.2%以下，用于直接飲用水處理時，丙烯酰胺含量需在0.05%以下。關于聚丙烯酰胺的毒性，某些陽離子型聚丙烯酰胺的情況就復雜得多，這是因為陽離子型聚丙烯酰胺引入的氨基類等基團，其毒性往往數十至數百倍地高于陰離子型和非離子型，他們的慢性毒性正進一步研究中。事實上，關于PAM的毒性早在1965年美國道化學公司McCollister等人就曾做了一份關于AM類聚合物的毒理學研究報告，他們對老鼠和狗進行了一次口服和兩年連續口服試驗，結果表明，即使飼喂5-10%濃度的高聚物也未發現有任何影響。日本有人曾用代表性的三類PAM進行老鼠試驗，其結果(LD50(大鼠一次口服))：HPAM在5000mg/kg以上;NPAM在6000 mg/kg以上;CPAM在5800 mg/kg以上。標注：【毒性分級(LD50(大鼠一次口服)):<50mg/kg為劇毒、高毒;50-4500mg/kg為低度、中毒;>4500基本無毒】。國際健康衛生組織1985年出生的聚丙烯酰胺標準指出：聚丙烯酰胺中殘留丙烯酰胺量控制在0.05%以下并控制用量時，處理后水中的含量將低于0.25ug/L，符合大多數國家的飲用水標準。PAM商品早已被美國環境保護局或食品、藥品管理局批準，可用于飲用水、糖汁澄清、水果、蔬菜洗滌等領域。PAM無毒，但PAM的原料單體AM則是有毒性的，尤其是對哺乳動物的神經有損害，因此，歐美國家包括我國都對食品級PAM中的殘余單體AM含量有其嚴格要求，一般要求低于0.05%，應用的最大劑量也是有限制的，但在廢水的處理、污泥脫水等領域里的應用，工作人員沒有必要擔憂PAM的毒性(殘單體)對人體的傷害。
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