中國21世紀議程管理中心于1994年3月25日經中央機構編制委員會辦公室批準成立，是國家科學技術部直屬的國家全額撥款的事業單位。
中心的主要職責是：承擔中國21世紀議程項目管理的有關工作；承擔國家高技術研究發展計劃資源環境技術、海洋技術領域計劃項目的過程管理和基礎性工作；承擔國家科技攻關計劃中資源、環境、公共安全及其他社會事業等領域和城市發展相關項目的過程管理和基礎性工作；承擔國家科技基礎條件平臺建設計劃中科學數據共享平臺、社會發展領域國家工程中心等的有關工作，推動可持續發展信息共享工作；承擔氣候變化等全球環境科技工作的組織實施，承擔清潔發展機制（CDM）等方面工作和項目的組織實施工作；承擔區域科技發展的有關工作，以及可持續發展實驗區管理工作，推動地方21世紀議程和地方可持續發展的實施工作；開展清潔技術生產、生態工業、循環經濟以及可持續發展領域的信息、技術與管理咨詢服務，推動社會發展領域科技成果示范與推廣，推動可持續發展能力建設工作；承擔可持續發展等領域的國際科技合作與交流工作；研究可持續發展相關領域的發展狀況、趨勢和重大問題，為科技部宏觀決策提出建議與對策；承擔有關司局委托的工作；承擔部領導交辦的其他工作。
中心成立以來，以推進《中國21世紀議程》實施，促進國家可持續發展為宗旨，依靠一支年輕化、專業化、國際化的精干團隊，促進了《中國21世紀議程》及其優先項目的實施；通過開展國家科技計劃中資源、環境、海洋、醫藥等領域的項目管理及成果推廣和產業化示范工作，依靠科技進步促進了可持續發展；開展了一系列可持續發展領域的戰略與政策研究，為政府宏觀決策提供了有力支撐；通過開展可持續發展實驗區的建設和管理，促進了地方的可持續發展；開展了中國可持續發展信息網絡建設，促進了我國可持續發展領域的信息交流與共享；通過廣泛開展可持續發展領域的國際合作，促進了中國與世界其他國家和地區在可持續發展領域的交流與合作；此外，通過開展可持續發展的宣傳、教育、培訓、技術咨詢與服務等項工作，促進了公眾可持續發展意識的提高。總之，通過十多年工作的開展，在促進國家可持續發展戰略中，與政府部門、研究機構、社會團體和企業界建立了良好合作關系；與國際社會卓有成效的合作，贏得了良好的國際聲譽，為促進我國社會實現可持續發展做出了貢獻。
綜合與監督處
處長：高新全 副處長：夏玉輝
·貫徹落實有關事業單位改革與發展的方針、政策，研究分析中心整體運行狀況，完善中心各項規章制度，為中心領導班子決策提出建議。
·協助中心領導協調中心行政的事務、承辦政務綜合、文件審核與管理、印章管理、工作督辦、會議、后勤保障、機要文件管理、信息安全和保密等工作，承擔中心內部行政監察工作。
·承擔中心工作人員的聘用、培訓、考核、監督、獎懲、工資福利和相關人事檔案管理，以及中心機構、職責與編制管理等工作。
·承擔中心財務、資產和經費管理等工作，承擔中心相關經費預、決算的財務審核、監督等工作。
·承擔對有關科技計劃項目和專項科技工作的過程管理和基礎性工作的監督工作。
·承辦中心簡報編制和政務信息報送工作。
·協助中心領導，承擔分管社團的業務活動、財務資產、年度檢查、對外交往、學術交流、辦報辦刊等的指導、監督工作。
·承擔中心黨支部和工會的日常工作，承擔中心安全保衛、離退休人員等具體工作。
·承辦中心領導交辦的其他工作。
戰略與政策研究處
處長：周海林 副處長：孫新章
·承擔關于可持續發展的重大戰略問題，以及可持續發展的國際動態、重大國際熱點等研究工作。
·承擔循環經濟、建設資源節約型和環境友好型社會等重大問題的研究工作。
·承擔公共安全、城市發展、社會公益及地方和區域可持續發展等領域的政策研究工作。
·承擔可持續發展能力建設以及宣傳培訓工作，推動可持續發展戰略以及國家可持續發展相關政策的實施。
·開展面向發展中國家制定21世紀議程等可持續發展規劃的培訓和咨詢服務。
·承擔與聯合國可持續發展委員會（CSD）等有關國際組織的交流與合作工作。
·承辦中心領導交辦的其他工作
社會事業與區域發展處
處長：張巧顯 副處長：張賢
·承擔攻關計劃公共安全、城市發展等領域項目的受理、篩選、中期檢查和項目驗收工作，提出項目立項建議、項目調整建議和項目驗收意見建議；參與跨部門、綜合性項目的組織實施管理工作；承擔攻關計劃公共安全、城市發展等領域的數據管理、文檔管理等基礎工作。
·承擔西部開發、振興東北老工業基地、奧運科技等科技行動專項和社會公益研究專項的過程管理工作，承擔數據匯總、信息、檔案資料管理等基礎性工作。
·承擔國家可持續發展實驗區辦公室的日常工作，承擔實驗區的受理、評審、中期檢查、驗收評審以及示范推廣等具體工作。
·承擔公共安全、城市發展、社會公益及地方和區域可持續發展等領域的成果推廣、宣傳與培訓工作。
·承擔地方、區域可持續發展以及社會事業方面的國際合作與交流工作。
·承辦中心領導交辦的其他工作。
信息處
處長：張書軍 副處長：邵宇賓
·承擔可持續發展信息共享及相關科技計劃項目的過程管理和基礎性工作。
·承擔中國可持續發展信息共享系統的建設和運行管理工作，開展基于信息共享的決策支持和服務工作。
·承擔科學數據共享工程辦公室的日常工作、科學數據共享工程門戶網站的建設工作，以及科學數據共享工程平臺建設的相關工作。
·負責中心網站、網絡及其他指定網站和應用系統的建設與信息采編等日常管理工作。
·承擔科技部、國家發改委“災害綜合研究組辦公室”的日常工作。
·開展可持續發展信息共享的國際合作與交流；
·承辦中心領導交辦的其他工作。
資源環境處
處長:王磊
·組織編制863計劃資源環境技術領域專題指南，承擔專題課題的申請受理、形式審查、評審評標、檢查驗收、課題經費預算的審核和評審，以及任務合同書的審核等工作。
·承擔863計劃資源環境技術領域部分重大、重點項目的組織實施工作，承擔項目課題的申請受理、形式審查、評審評標、經費預算評審、任務合同書審核、檢查驗收等工作，提出項目的課題立項建議、課題調整建議和課題驗收意見。
·承擔863計劃資源環境技術領域有關數據統計分析、年度報告編制、資料檔案管理和出版物等基礎性工作。
·承擔863計劃資源環境技術領域專家組的支撐和服務工作。
·承擔攻關計劃資源環境領域項目的受理、篩選、中期檢查和項目驗收工作，提出項目立項建議、項目調整建議和項目驗收意見建議；參與跨部門、綜合性項目的組織實施管理工作；承擔攻關計劃資源環境領域的數據管理、文檔管理、宣傳等基礎工作。
·研究資源環境領域科技發展狀況、趨勢和重大問題，提出相關建議。
·開展資源環境領域的國際科技合作與交流。
·承辦中心領導交辦的其他工作。
海洋處
處長：孫清 副處長：王文濤
·組織編制863計劃海洋技術領域專題指南，承擔專題課題的申請受理、形式審查、評審評標、檢查驗收、課題經費預算的審核和評審，以及任務合同書的審核等工作。
·承擔863計劃海洋技術領域部分重大、重點項目的組織實施工作，承擔項目課題的申請受理、形式審查、評審評標、經費預算評審、任務合同書審核、檢查驗收等工作，提出項目的課題立項建議、課題調整建議和課題驗收意見。
·承擔863計劃海洋技術領域有關數據統計分析、年度報告編制、資料檔案管理和出版物等基礎性工作。
·承擔863計劃海洋技術領域專家組的支撐和服務工作。
·承擔攻關計劃海洋領域項目的受理、篩選、中期檢查和項目驗收工作，提出項目立項建議、項目調整建議和項目驗收意見建議；參與跨部門、綜合性項目的組織實施管理工作；承擔攻關計劃海洋領域的數據管理、文檔管理、宣傳等基礎工作。
·研究海洋領域科技發展狀況、趨勢和重大問題，提出相關建議。
·開展海洋領域的國際科技合作與交流。
·承辦中心領導交辦的其他工作。
全球環境處
副處長: 仲平（主持工作）
·承擔科技部全球環境辦公室的日常工作，為全球環境科技協調領導小組、顧問委員會和專家組提供支撐服務。
·承擔科技計劃中有關全球環境領域項目的過程管理和基礎性工作。
·參與氣候變化等全球環境公約的談判與國內履約工作。
·承擔與全球環境相關的科技宣傳、培訓等能力建設工作。
·承擔與全球環境相關的重大問題研究，提出相關對策建議。
·開展全球環境領域的國際科技合作與交流。
·承辦中心領導交辦的其他工作。
清潔技術發展處
處長: 裴志永 副處長：樊俊
·組織開展清潔發展機制（CDM）國際合作項目的開發、實施管理與技術服務。
·承擔清潔發展機制（CDM）科技計劃項目的過程管理工作。
·開展清潔技術、資源節約與循環利用技術以及環境無害化技術的項目開發、科技示范與推廣。
·承擔與清潔生產、生態工作、循環經濟以及可持續商業發展相關的培訓與能力建設、國際科技合作以及面向社會與企業的信息、技術與管理咨詢服務工作。
·承擔中美可持續發展中心中方秘書處工作。
·承辦中心領導交辦的其他工作。
